OVERVIEW


GenomonはExomeシークエンスの結果であるFASTQファイルのマッピング,データ解析を行いMutationの候補の一覧を出力するソフトウェアです.ライセンスの元で自由に使用・改変・再配布が可能です.Genomonは様々なオープンソフトウェアを組み合わせたパイプラインと呼ばれるソフトです.ヒトゲノム(hg19)のみに対応しています.

Genomonは
  東京大学 医科学研究所 ヒトゲノム解析センター 宮野悟研究室
  東京大学 医学部附属病院 キャンサーボード 小川誠司研究室
の共同研究のもとで開発されたものです.

Genomonは Genomon License のもとで配布されているパイプラインソフトウェアです. ヒトゲノム解析センター(HGC)のスーパーコンピュータ にのみ対応しています. ライセンスの元で自由に使用・改変・再配布が可能です.詳しくは ライセンス をよくお読みください.

githubでソースを公開しています. https://github.com/Genomon/genomon
インストールの方法は INSTALL ページをお読みください.

Genomonは 文部科学省新学術領域研究「システムがん」 で利用され,解析した成果が論文になってます.

Genomonはマッピング&データ解析パイプラインです.

FEATURES


Genomon は以下の特徴を備えています.

ACKNOWLEDGEMENTS


Genomonは 文部科学省新学術領域研究「システムがん」 のもとで開発されたものです.

このソフトウェアは下記の公開されているソフトウェアを使用します.
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